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과제 정보

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프로젝트 고유번호 1711072542

과제 상세 정보

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과제 제목 진행성 대장암 예후 예측 바이오마커 발굴 및 임상유용성 검증
과제 설명 바이오마커 탐색을 위해 생산한 오믹스 데이터는 폭발적으로 축적되어가고 있음. 그러나 임상 암조직샘플의 특성과 분석기술의 한계로 인해, 지금까지 보고된 많은 대장암 바이오마커들은 정확도에 한계가 있고, 결과적으로 임상적 유용성도 제한적임. 본 연구는, 전사체/후성유전체 데이터를 통합 분석하여 바이오마커를 발굴할 때 이러한 한계를 극복하기 위해서, 침윤면역세포를 포함한 암조직에 존재하는 다양한 정상세포들을 고려하는 새로운 방법을 적용하고자 함. 이러한 접근법을 이용하여 1) 대장암 조직 샘플 전사체/후성유전체 데이터를 생산 (n=300) 하고, 정확도가 제고된 조직 샘플 기반 후성유전체 바이오마커 발굴하고 임상검증 2) 혈액 샘플에 기반한 대장암 특이적 후성유전체 바이오마커 발굴/임상검증하여 비침습적 진단으로 확대 적용 3) 후성유전체 바이오마커를 검출용 패널 시퀀싱 진단 시스템을 개발함을 최종 목표로 함. 또한 본 과제에서 구축한 분석 방법 및 진단법은 세부과제간 연계를 통해 간암 특이적 바이오마커 검증 및 진단시스템 개발에 활용함.|-대장암 코호트 구축 및 조직 샘플 전사체 /후성유전체 통합 데이터 확보 (n=300) -단일세포 데이터 및 공개데이터를 활용한 세포구성 및 세포종류별 분석과 전사체/후성유전체 통합 분석을 통한 후성유전체 바이오마커 발굴 고도화 -후향적 코호트에서 후성유전체 바이오마커 발굴 (n=200) 및 전향적 코호트에서 검증 (n=100) -혈액 샘플(n=100)에 기반한 대장암 특이적 바이오마커 발굴/검증 및 비침습적 진단법 개발 -후성유전체 바이오마커를 검출용 패널시퀀싱 진단 시스템을 시작품 개발 및 분석적 성능평가 |주요 선진국들은 국가단위의 게놈프로젝트를 진행하고, 전세계적으로 NGS를 포함한 오믹스 데이터가 매년 2배이상씩 늘어나고 있다고 추정되며, 이미 TCGA에만 2.5 페타바이트 데이터가 축적되어있음. 이러한 추세는 오믹스 데이터를 축적하는 것이 중요하다는 것을 명백히 보여주는 한편, 기존 데이터를 잘 활용하는 것이 매우 중요함을 반증함. 본 연구는 다양한 기존 공개 데이터들을 활용하여, 대장암 후성유전체 바이오마커를 고도화 함으로써, 대장암 환자의 재발 모니터링을 보다 효율화할 것으로 기대됨. 기존 바이오마커의 한계점을 극복할 수 있는 모델을 제시한다는 점에서 대장암에 국한되지 않고, 모든 암종에 걸쳐 오믹스 기반 바이오마커 발굴에 활용될 것으로 기대됨. 또한 비침습적 진단법으로 확대하여 정밀 치료를 가속화할 것으로 기대됨.
과제 책임자 박동현 등록자 김가현
종명 Homo sapiens데이터 형식 정보없음
등록기관 삼성서울병원공개일 2019-11-21

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연구목표 정보없음
연구내용 정보없음
연구효과 정보없음
한글 키워드 정보없음
영문 키워드 정보없음

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accession,
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Homo sapiens 2019-11-21 정보없음 정보없음