유전체 정보 연계 시스템 Genome InfraNet

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과제 정보

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프로젝트 고유번호 1711044760

과제 상세 정보

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과제 제목 NGS기반 약물작용점 분석의 생물정보학 인프라 구축
과제 설명 분열 호모 전체 유전자 결손 라이브러리를 이용한 질병의 이해 및 약물 작용점 분석을 위해 차세대 염기서열 결정 기술(NGS)을 활용하는 barcode-seq 데이터를 분석하는 시스템을 활용하여, 1세부 과제에서 만드는 데이터들을 분석함 또한, 분열 효모 약물 작용점 스크리닝 결과들을 통합 분석하고 연구자들이 쉽게 활용할 수 있는 웹 데이터베이스를 구축하여 제공함
과제 책임자 김선영 등록자 윤병하
종명 mus musculus,rattus norvegicus데이터 형식 정보없음
등록기관 한국생명공학연구원공개일 2019-07-18

과제 설명

과제 상세 정보
연구목표 분열 호모 전체 유전자 결손 라이브러리를 이용한 질병의 이해 및 약물 작용점 분석을 위해 차세대 염기서열 결정 기술(NGS)을 활용하는 barcode-seq 데이터를 분석하는 시스템을 활용하여, 1세부 과제에서 만드는 데이터들을 분석함 또한, 분열 효모 약물 작용점 스크리닝 결과들을 통합 분석하고 연구자들이 쉽게 활용할 수 있는 웹 데이터베이스를 구축하여 제공함
연구내용 Barcode-seq 데이터 분석 1단계에서 개발하였던 BarSeq-Browser 프로그램 및 분석 파이프라인을 활용하여 1세부 생산하는 barcode-seq 데이터를 분석하고, 결과를 1세부에 제공 Barcode-seq 데이터 분석 소프트웨어 개선 기존에 개발하였던 BarSeq-Browser 프로그램을 개선하여 barcode preprocessing 기능을 강화한 Barcas 프로그램으로 발전시킴 약물작용점 탐색 데이터 DB 구축: 또한, 다양한 약물 처리 및 질병 단백질 과발현 조건에서 생산되는 생물학적 데이터들을 통합 분석하고, 그 결과들을 연구자들이 쉽게 사용할 수 있는 웹 데이터베이스로 구축함.
연구효과 본 연구 과제에서 생산되는 분열효모 균주의 barcode-seeq 데이터를 정리, 분석, 통합하여 인간 질병 관련 유전자 및 약물 작용점 데이터베이스를 구축하면 연구자들이 in vivo assay로부터 유래하는
한글 키워드 1) 새로운 질병 관련 유전자에 대한 정보
영문 키워드 2) 새로운 약물 및 약물 작용점 발견을 위한 정보 등을 손쉽게 얻을 수 있어 인간의 질병에 대한 이해를 이를 치료하기 위한 약물을 개발하는데 유용하게 사용할 수 있음

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accession,
생물종 공개일 DNA/RNA 선택법 시퀀싱 타입 상세보기
mus musculus,rattus norvegicus 2019-07-18 정보없음 정보없음