유전체 정보 연계 시스템 Genome InfraNet

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과제 정보

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프로젝트 고유번호 1711044727

과제 상세 정보

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과제 제목 분열효모 유전자 결손 라이브러리와 차세대 염기서열분석
과제 설명 분열효모 (S.pombe)는 약 ~5000종의 유전자를 가지며, 본 연구팀은 각 유전자당 약 20-mer의 특이적 DNA서열 (bar-code)를 삽입한 유전자 결실 라이브러리를 제조(Nature Biotech. 2010, 28(6):617) 균주 라이브러리는 개별적 유전자의 기능연구 뿐만 아니라 균주에 삽입된 고유의 바코드는 pool과 NGS를 활용한 약물작용점 탐색도 가능하게 함 본 연구에서는 NGS(next generation sequencing) 기술을 활용한 임상다빈도 면역억제제 4종과 항 우울제 6종의 약물작용점 탐색을 시도 NGS를 통한 분석후 결과는 bioinformatics를 통하여 가공하고, 웹-기반 자료 공개|① NGS 기반 약물작용점 분석기술 확립 및 최적화 | -NGS 분석기술 최적화 NGS를 통한 약물작용점 분석의 최적조건을 확립 Microarray 기반으로 분석한 기존의 약물을 NGS 기법으로 재분석 후 비교 | ② 임상 다빈도 면역억제제 4종, 항 우울제 6종의 약물작용점 분석 | -면역억제제 4종 분석: 분열효모에 약물민감성을 보이는 면역억제제 20종을 선정하고, IC50가 300μM 이하인 후보 4종을 선정하여 NGS 기법으로 작용점분석 | -항 우울제 6종 분석: 분열효모에 약물민감성을 보이는 항 우울제 후보 10종을 선정하고, IC50가 300μM 이하인 후보 6종을 선정하여 NGS 기법으로 작용점분석 | -면역억제제10종 분석: 분열효모에 약물민감성을 보이는 면역억제제 20종을 선정하고, IC50가 300μM 이하인 후보 10종을 선정하여 NGS 기법으로 작용점분석 | ③ 약물 타겟의 생화학/유전학적 검증 및 자료 공유 | -약물 타깃 단백질의 작용기전을 생화학/유전학적 기법으로 검증 (Phenotype 분석, gain-of-function 및 세포주/선충 활용 si-RNA 분석 등) | -약물작용점 분석을 통한 약물 타깃은 기존의 약물 DB와 비교 분석 하여 웹-기반 시스템을 구축하여 자료 공유(제3세부)|약물의 작용점 및 부작용의 이해를 돕고, 그를 통한 신약 개발의 기초를 제공 면역억제제가 가지는 작용기작 및 항 우울제의 타깃을 이해하고, 면역억제제의 작용점을 분석 본 연구팀이 가지는 세계유일의 분열효모 유전자 결손 균주는 미국이 보유한 발아효모 시스템과 상호보완적으로 약물작용점 연구가 가능하며, 인간 유전자와의 유사성을 가짐으로 상위 모델세포로의 연구 확대가 가능함
과제 책임자 허광래 등록자 박종열,박승진
종명 Homo sapiens,Saccharomyces cerevisiae데이터 형식 정보없음
등록기관 충남대학교공개일 2019-07-18

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연구목표 정보없음
연구내용 정보없음
연구효과 정보없음
한글 키워드 정보없음
영문 키워드 정보없음

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생물종 공개일 DNA/RNA 선택법 시퀀싱 타입 상세보기
Homo sapiens,Saccharomyces cerevisiae 2019-07-18 정보없음 정보없음