유전체 정보 연계 시스템 Genome InfraNet

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과제 정보

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프로젝트 고유번호 1711041874

과제 상세 정보

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과제 제목 세포 특이적 후성유전체마커 발굴 및 검증
과제 설명 줄기세포 및 신경세포 특이적인 lncRNA 표준유전체와 신경질환변이 유전체 규명 lncRNA 유전체 탐색 및 기능 분석을 위한 네트워크 분석 시스템 개발 치료용 줄기세포 제조를 위한 타겟 lncRNA 3종 확보 lncRNA를 이용한 치료용 신경질환 줄기세포 분화 기술 및 체외 질환모델 개발 국내 호발암 특이적 후성유전체 마커 확보 및 국제협력 결과를 활용한 맞춤형 암 진단 원천기술 개발|1. 인간 유도만능줄기세포 (iPSC)의 신경분화 관련 lncRNA 탐색 iPSC 미분화 및 신경분화 단계별 lncRNA 발현 profile 분석 특정 lncRNA 손실 줄기세포의 전사체 및 후성유전체 데이터 생산 | 2. 인간 유도만능줄기세포의 신경분화 관련 lncRNA 기전 규명 lncRNA을 knockdown한 iPSC 라인의 신경분화 능력 검증 lncRNA가 손실된 iPSC의 전사체 및 후성유전체 변이 분석 신경 분화 조절 기능을 가지는 lncRNA의 작용 기전 규명 뇌신경질환 유래 iPSC의 lncRNA 비교분석을 통한 질환 특이적 lncRNA 발굴 | 3. lncRNA의 기능 분석을 위한 생물정보 시스템 개발 lncRNA 발굴 알고리즘 및 파이프라인 개발 신경세포 분화에 특이적인 lncRNA 탐색 알고리즘 개발 lncRNA의 타겟 규명을 위한 전사 조절 네트워크 분석기술 개발 고급 데이터마이닝을 통한 lncRNA 기능 분석 방법 개발 | 4. lncRNA를 이용한 유전자 치료용 줄기세포 개발 치료용 lncRNA를 이용하여 전환된 iPSC와 신경 분화 세포 개발 | 5. 호발암 특이적 DNA methylation 변이 분석 지역 설정 TCGA에 있는 400 여명의 호발암 환자로부터 얻은 암 조직의 DNA methylation data를 분석 | 6. Array 기반의 DNA methylation data 기본 분석 | 7. 호발암 특이적 후성유전체 (DNA methylation) 마커 탐색 DMR에 의해 영향을 받는 유전자들의 network를 분석하고 임상 데이터와 DMR 데이터를 연계 분석해 암 환자의 예후 예측, 분자 진단, 및 치료 타겟 선정이 가능한 마커들을 탐색함 | 8. 호발암에 대한 유전체 분석 호발암에서 확인한 모든 유전자 돌연변이의 분석을 통해 호발암 특이적으로 문제가 발생하는 pathway를 찾아내고, network 분석 및 임상 데이터 연계 분석을 통해 암 환자의 예후 예측, 분자 진단, 치료 타겟 선정이 가능한 마커들을 탐색함. | 9. 호발암 유전체와 후성유전체 연계 분석 한 사람의 암 환자에서 얻어 낸 유전체 변이 데이터와 후성 유전체 변이 데이터를 함께 사용하여 암 환자의 예후 예측, 분자 진단, 및 치료 타겟 선정이 가능한 마커들을 탐색함 | 10. 포스트게놈다부처유전체 사업에 대해 미래부와 재단의 총괄 업무 기능 담당|1. iPSC 분화 조절에 필요한 lncRNA를 발굴하여 치료용 줄기세포를 제조할 수 있는 기술 개발이 가능해 질 것으로 예상됨 | 2. 국제 컨소시엄 참여를 통해 lncRNA 활용에 대한 다양한 기술 및 데이터 확보가 가능해져 국내 세포분화 유전자 제어 기술 발전에 기여할 것으로 기대됨 | 3. 새로운 유전자 소재인 lncRNA에 대한 원천기술을 확보하며, 질환의 보다 정확한 진단 및 효율적인 치료에 활용 가능할 것으로 기대됨 | 4. 연구결과물의 논문 및 특허 출원 2년 단위로 연구유형 1 과제 결과 분석을 통해 분석 환자의 예후나 치료 효과를 예측할 수 있는 후성 유전체 바이오 마커에 대한 논문과 국제특허 출원을 각 암에 대해 1건씩 총 4건을 1단계 확보 2단계에서는 후성유전체와 유전체 연계 분석을 통한 암 진단 기술을 발전시켜 논문 및 특허 (국제) 출원 2건 이상 확보 | 5. 사업 모델(Business Model) 정립 2단계에서는 1단계에서 분석이 마무리된 암 종에 대한 후성유전체 바이오마커와 유전체 바이오 마커를 시험군의 암 환자에게 적용하여 발굴된 바이오 마커의 예민도와 정확도를 검증하고 그 결과를 바탕으로 암 환자에 대한 분자 진단 서비스 기술을 확립하여 사업화 추진
과제 책임자 김영준 등록자 김영준,최원영
종명 Homo sapiens데이터 형식 정보없음
등록기관 연세대학교공개일 2020-07-09

과제 설명

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연구목표 정보없음
연구내용 정보없음
연구효과 정보없음
한글 키워드 정보없음
영문 키워드 정보없음

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Homo sapiens 2020-07-09 정보없음 정보없음