유전체 정보 연계 시스템 Genome InfraNet

샘플

과제 정보

과제 정보
프로젝트 고유번호 1711032066

과제 상세 정보

과제 상세 정보
과제 제목 간질환 통합 RNA유전체 기반 확립 및 기전 규명 연구
과제 설명 본 연구의 최종 목표는 기 확보된 다양한 간질환 (만성간염, 간경화, 간세포성간암) 조직으로부터 NGS (Next generation sequencing) 분석 기법의 활용으로 전장전사체 해독을 시행하고 동일 시료로부터 확보되어 있는 칩기반 발현전사체 (transcriptome) 및 miRNome 데이터를 통합하여 1 단계에서는 간세포성 간암에 관한 통합RNA유전체 데이터 확보를, 2단계에서는 만성간질환 (만성간염, 간경화)의 시퀀싱 데이터를 확보함에 따라 궁극적으로 최초 한국인 다단계 간질환 통합RNA유전체 데이터를 확립하고자 함. 또한 이들 통합RNA유전체 데이터에 대한 시스템적 분석을 통하여 새로운 간질환 및 간암 기전을 제시하고 검증하고자 함.|1. 정상 및 간질환병기별 조직의 전장 전사체 해독 칩기반 전장 전사체 데이터와 miRNome 데이터가 분석되어 있는 간질환 병기 (간암전구병변, 만성간염, 간경화) 로 분류 되어 있는 병기 조직 각 각 20례에 대한 RNA-seq 기반 전장전사체 해독 | 2. RNA-seq 기반 전장전사체 데이터 검증 칩기반 전장전사체 데이터와 RNA-seq기반 전장 전사체 데이터의 Gene-set enrichment 분석 (GSEA) 비교 통한 데이터 상호 검증 | 3. 칩기반 전장 전사체 및 miRNome 데이터 통합분석을 통하여 신규 후성유전체 영향인자 발굴 정상 간조직 및 간세포성 간암 조직에 대한 칩기반 전장전사체 및 miRNome 데이터 통합 분석으로부터 후성유전체 영향인자에 의한 새로운 간암 기전 제시 및 검증 | 4. 칩기반 및 RNA-seq 기반의 전장전사체와 miRNome 데이터와 통합 및 분석 칩기반 전장 전사체 및 RNA-seq기반 전장 전사체 데이터 구축 및 비교 분석 시행 만성 간질환 관련 차별 발현 변화된 신규 유전자 발굴, non-coding RNA 발굴, alternative splicing variant 발굴, 융합유전자 발굴 | 5. 통합RNA유전체기반 만성 간질환 바이오마커 규명 및 간암기전 연구 우수성 및 차별성 검증 칩기반 및 시퀀싱 기반으로 확보된 통합RNA유전체데이터로부터 도출된 신규 후성유전체 영향인자에 대한 간암 기전의 분자세포생물학적 기능 규명을 시행하고, 신속하고 신뢰성 있는 신규한 만성 간기전 바이오마커를 규명하고 검증함으로써 최초 한국인 다단계 간질환 통합 RNA 유전체 데이터 활용의 차별화 제시|통합RNA유전체데이터 활용에 의한 신규 간질환 바이오마커를 제시하고 간암의 분자생물학적 작용기전을 검증 및 규명함으로써 간질환 및 간암 관련 신약타겟발굴에 기여할 것으로 사료됨간질환 및 간암 관련 신규 타겟을 대상으로 하는 국내 및 국제 특허출원이 가능할 것으로 기대되며, 향후 경쟁력을 갖춘 표적지향적/맞춤형 바이오의약 개발로 이어질 수 있을 것으로 기대됨 향후 간질환뿐만 아니라 통합 RNA유전체 데이터를 활용한 기전규명 전략을 다른 여러 고형암에도 응용될 수 있는 새로운 개념의 신약 타겟 유전자 발굴 연구의 방향을 제시함
과제 책임자 남석우 등록자 남석우
종명 Homo sapiens,간 세포주,간질환 환자의 간조직데이터 형식 정보없음
등록기관 가톨릭대학교(성의교정)공개일 2020-06-30

과제 설명

과제 상세 정보
연구목표 정보없음
연구내용 정보없음
연구효과 정보없음
한글 키워드 정보없음
영문 키워드 정보없음

샘플 목록

accession,
생물종 공개일 DNA/RNA 선택법 시퀀싱 타입 상세보기
Homo sapiens,간 세포주,간질환 환자의 간조직 2020-06-30 정보없음 정보없음