유전체 정보 연계 시스템 Genome InfraNet

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과제 정보

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프로젝트 고유번호 1711030683

과제 상세 정보

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과제 제목 대용량 유전자 시그너쳐 기반의 조절 네트워크, pathway 및 약물유전체 통합분석 시스템 개발
과제 설명 대량의 유전자 발현 변화(시그너쳐), 약물반응 데이터 및, 다양한 pathway 데이터를 기반으로 네트워크 구성, 전사 조절 네트워크 모듈, pathway, 질병-약물-유전체 네트워크 및 단백질 상호작용 등을 모두 분석할 수 있는 통합 분석시스템을 구축하고, 수요자 맞춤형 서비스를 제공함|다양한 네트워크 및 pathway 정보 수집 및 데이터베이스화 단백질 상호작용, 대사 및 신호전달 경로, 전사 조절 네트워크, 약물-유전자 연관성 데이터, 질병-유전자 연관성 데이터, 약물유전체 데이터 등 다양한 데이터마이닝 정보의 수집 및 데이터베이스화 대용량 유전자 발현 변화(시그너쳐) 구축 및 모듈 분석 알고리즘 개발 Human, mouse 등의 8개 주요 종에 대하여 RNA-seq 및 마이크로어레이 등 대량의 유전자 발현 변화(시그너쳐) 데이터를 수집 전사조절 및 miRNA조절 네트워크 모듈, pathway, 약물유전체 등을 모두 분석할 수 있는 통합 알고리즘 개발 웹 기반 혹은 standalone의 네트워크 및 pathway 통합 분석 시스템 구축 사용자 편의성이 강화된 웹 기반 통합 분석 시스템 구축 및 서비스 제공 다양한 네트워크 및 pathway 시각화 모듈 및 통계 분석 모듈 제공 대용량 데이터 분석에 적합한 standalone 소프트웨어 개발 통합지원과제와의 연계 시스템 구축 KOBIC을 통한 분석 서비스 제공을 위한 연계 시스템 구축 수요자 맞춤형 서비스 제공 및 공동/협력연구 체계 강화 수요자의 다양한 요구에 따른 일대일 맞춤형 분석 서비스 제공|다양한 네트워크 및 pathway 분석 기능을 제공함으로써 다부처 유전체 사업에서 생산되는 대용량 데이터들로부터 생물학적 의미를 찾을 수 있도록 함 다양한 세포조건에서 조건 특이적인 조절 네트워크를 입체적으로 분석할 수 있고, 조건 특이적인 pathway의 변화, 유전자 리스트(약물반응)와 유사한 세포조건 등을 연결시키는 등 동일한 시스템 내의 복합적인 분석이 가능함. 새로운 조절 타겟 및 관련된 질병의 기작의 이해 확대 및 drug repositioning 등의 응용 연구에 폭넓게 활용 가능함
과제 책임자 김선영 등록자 김종환
종명 Homo sapiens,Saccharomyces cerevisiae데이터 형식 정보없음
등록기관 한국생명공학연구원공개일 2020-06-30

과제 설명

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연구목표 정보없음
연구내용 정보없음
연구효과 정보없음
한글 키워드 정보없음
영문 키워드 정보없음

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accession,
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Homo sapiens,Saccharomyces cerevisiae 2020-06-30 정보없음 정보없음