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프로젝트 고유번호 1711020733

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과제 제목 분열효모 유전자결손 라이브러리와 차세대 염기서열분석
과제 설명 많은 Many intrinsically disordered proteins (IUP)가 헌팅턴, 알쯔하이머, 파킨슨 질환의 원인이 됨이 밝혀지고 있다. 이런 퇴행성뇌질환에서 IUP단백질의 역할을 규명하고자, 효모의 유전자결손 라이브러리 균주에 원인 유전자를 과발현 후, NGS같은 방법으로 전체균주의 성장도를 측정하는 방법으로 질환의 근본원인을 간접적으로 규명하고자한다. 동일하게 비알콜성 지방간염에서 주요 유전자인 SREBP 기능을 앞서 말한 효모 시스템을 이용하여 연구하고자한다.
과제 책임자 김동욱 등록자 박성진
종명 Schizosaccharomyces pombe데이터 형식 정보없음
등록기관 한국생명공학연구원공개일 2017-11-01

과제 설명

과제 상세 정보
연구목표 많은 Many intrinsically disordered proteins (IUP)가 헌팅턴, 알쯔하이머, 파킨슨 질환의 원인이 됨이 밝혀지고 있다. 이런 퇴행성뇌질환에서 IUP단백질의 역할을 규명하고자, 효모의 유전자결손 라이브러리 균주에 원인 유전자를 과발현 후, NGS같은 방법으로 전체균주의 성장도를 측정하는 방법으로 질환의 근본원인을 간접적으로 규명하고자한다. 동일하게 비알콜성 지방간염에서 주요 유전자인 SREBP 기능을 앞서 말한 효모 시스템을 이용하여 연구하고자한다.
연구내용 ■ α-synuclein 세포 독성 조절인자발굴 및 NGS기반 스크리닝 시스템 구축 - α-synuclein(α-syn.)에 의한 독성을 조절하는 specific modifier(suppressor or enhancer)를 찾기 위해서 3,200종의 분열효모 haploid균주에 α-syn.을 발현 후 Microarray 및 NGS로 분석 - NGS 및 chip based microarray 분석결과를 가지고 GO분석을 한 결과, TOR signaling cascade, Transport categories가 상위후보군으로 나오는 결과를 얻을 수 있었음. 상위 150개의 유전자 중 cdc11, tco89, rec11, pmo25, smb1 등의 유전자가 TOR signaling categories에 포함됨을 관찰 - 심층분석을 통해 vps17, Sft1, Smb1 등의 결실 유전자에서 wild type 에 비해 독성효과가 크게 나타나는 것을 발견 - vps17과 linkage를 이루는 5종(stc1, mug186, vps5, vps29, vps26)과 sft1과 linkage를 이루는 2종(stc1, gos1)을 발견 -Gene Ontology(GO) 분석 시 transport, vesicle-mediated transport, ER to Golgi vesicle-mediated transport 등에 관여하는 것으로 탐색되어 발아효모와 비슷한 경향성을 보임 - WT α-syn. 에서 나온 후보를 A53T α-syn.을 과발현하였을 때 모두 유사한 독성조절을 보임. 하지만 A30P α-syn.은 세포독성을 보이지 않음. 이는 발아효모와 유사한 결과 얻음
연구효과 ■ 분열효모의 SREBP인 Sre1 활성조절인자 발굴 -3,200종의 분열효모 haploid균주들을 대상으로 혐기조건(-O2)과 CoCl2 조건에서 민감성을 보이는 균주들을 NGS 및 chip based microarray 분석 및 one-by-one 으로 streaking 방법을 이용하여 screening을 수행한 결과, 총 33종의 SREBP조절 유전자 후보 발굴 -SRE1N에 의해 생장이 recovery되는지 검증하여 최종 ssh1, scp1, rdb2, hem14이 4종이 SREBP조절 신규유전자임을 규명 함
한글 키워드 ㅇ PD와 AD의 원인 유전자인 α-synuclein의 신규조절인자 발굴로 퇴행성질환 정복에 기여
영문 키워드 ㅇ 신규 SREBP조절인자를 발굴함으로서 비알콜성간염 질환 정복에 기여

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Schizosaccharomyces pombe 2017-11-01 정보없음 정보없음