분열효모 유전자 결손 라이브러리와 차세대 염기서열분석

데이터 샘플 번호: [1711031991]

과제 정보

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프로젝트 고유번호 1711031991

과제 상세 정보

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과제 제목 분열효모 유전자 결손 라이브러리와 차세대 염기서열분석
과제 설명 정보없음
과제 책임자 이숙정 등록자 김종환
종명 Schizosaccharomyces pombe 데이터 형식 정보없음
등록기관 충남대학교 공개일 2021-09-30

과제 설명

과제 상세 정보
연구목표 분열효모 (S.pombe)는 약 ~5000종의 유전자를 가지며, 본 연구팀은 각 유전자당 약 20-mer의 특이적 DNA서열 (bar-code)를 삽입한 유전자 결실 라이브러리를 제조(Nature Biotech. 2010, 28(6):617) 균주 라이브러리는 개별적 유전자의 기능연구 뿐만 아니라 균주에 삽입된 고유의 바코드는 pool과 NGS를 활용한 약물작용점 탐색도 가능하게 함 본 연구에서는 NGS(next generation sequencing) 기술을 활용한 임상다빈도 항암제 10종과 항진균제, 면역조절제의 약물작용점 탐색을 시도 NGS를 통한 분석후 결과는 bioinformatics를 통하여 가공하고, 웹-기반 자료 공개
연구내용 ① NGS 기반 약물작용점 분석기술 확립 및 최적화 -NGS 분석기술 최적화 NGS를 통한 약물작용점 분석의 최적조건을 확립 Microarray 기반으로 분석한 기존의 약물을 NGS 기법으로 재분석 후 비교
② 임상 다빈도 항암제 10종 및 항진균제 5종, 면역억제제 10종의 약물작용점 분석 -항암제 10종 분석: 분열효모에 약물민감성을 보이는 항암제 후보 20종을 선정하고, IC50가 300 μM 이하인 후보 10여종을 선정하여 NGS기법으로 작용점분석 -항진균제 5종 분석: 분열효모에 약물민감성을 보이는 항진균제 후보 10종을 선정하고, IC50가 300μM 이하인 후보 5종을 선정하여 NGS 기법으로 작용점분석 -면역억제제10종 분석: 분열효모에 약물민감성을 보이는 면역억제제 20종을 선정하고, IC50가 300μM 이하인 후보 10종을 선정하여 NGS 기법으로 작용점분석
③ 약물 타겟의 생화학/유전학적 검증 및 자료 공유 -약물 타겟 단백질의 작용기전을 생화학/유전학적 기법으로 검증 (Phenotype 분석, gain-of-function 및 세포주/선충 활용 si-RNA 분석 등) -약물작용점 분석을 통한 약물 타겟은 기존의 약물 DB와 비교 분석 하여 웹-기반 시스템을 구축하여 자료 공유(제3세부)
연구효과 약물의 작용점 및 부작용의 이해를 돕고, 그를 통한 신약 개발의 기초를 제공항암제가 가지는 세포독성의 작용기작 및 항진균제의 타겟을 이해하고, 면역억제제의 작용점을 분석본 연구팀이 가지는 세계유일의 분열효모 유전자 결손 균주는 미국이 보유한 발아효모 시스템과 상호보완적으로 약물작용점 연구가 가능하며, 인간 유전자와의 유사성을 가짐으로 상위 모델세포로의 연구확대가 가능함
한글 키워드 차세대 염기서열분석,항암제,약물타겟검증,항진균제
영문 키워드 Nextgenerationsequencing,Anticancerdrug,Drugmodeofaction,Antifungaldrug

데이터 세트

데이터 정보
샘플 고유 번호 샘플 데이터 제목 상세 설명 데이터 수
정보없음 정보없음 정보없음 380

실험 정보

실험 정보
Sequencer 정보없음 Adaptor Sequence 정보없음
Raw Data Types 정보없음 Insert Size 정보없음
Read Length 정보없음 Read Type 정보없음

샘플 파일

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