유전체 정보 연계 시스템 Genome InfraNet

분석 프로그램 검색

Study : 1711044752

연구과제 정보

accession,
2014M3C9A3063541
1711044752
멀티 오믹스 분석 알고리즘 및 플랫폼 개발
미래부
서울대학교
김선
2016
2016-11-01 ~ 2017-08-31
김선
sunkim.bioinfo@snu.ac.kr
028807280

등록 프로그램 / 파이프라인 / 웹 서비스 정보

accession,

1. 분석 파이프라인   2. 전사체 분석

한글명칭 인실리코 가설 검증 실험도구
영문명칭
프로그램 in silico.zip
매뉴얼 Manual - in silico experiment.pdf
모식도 프로그램 전체 모식도 없음
웹 서비스 주소
주요 내용 특징 사용자가 입력한 NGS 데이터에 대해서 가설을 검증할 수 있는 도구이다. 먼저 사용자가 입력한 자연어로 된 가설을 유전자 세트로 바꾸어 주고, 입력한 유전자의 발현 정보를 이용하여 세가지 생물학 네트워크 (TF, PPI, miRNA 네트워크) 를 이용하여 조절 네트워크를 만든 후, 만들어진 네트워크의 복잡도를 계산하여 가설을 검증한다. 복잡도가 높을 수록 유전자 간의 높은 연관성을 의미하여 가설 검증이 가능하도록 하였다.
주요 기능 사용자가 웹을 통해 쉽게 이용 가능하도록 만들어 졌으며, 유전자의 발현 정보로부터 가설을 검증하기 위한 유전자 간의 네트워크 분석을 하도록 만들어 졌다.
사용방법
LINUX
기타