Study : 1711044752
연구과제 정보
| 2014M3C9A3063541 | |
| 1711044752 | |
| 멀티 오믹스 분석 알고리즘 및 플랫폼 개발 | |
| 미래부 | |
| 서울대학교 | |
| 김선 | |
| 2016 | |
| 2016-11-01 ~ 2017-08-31 | |
| 김선 | |
| sunkim.bioinfo@snu.ac.kr | |
| 028807280 |
등록 프로그램 / 파이프라인 / 웹 서비스 정보
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1. 분석 파이프라인 2. 전사체 분석 |
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| 한글명칭 | 인실리코 가설 검증 실험도구 | |
| 영문명칭 | ||
| 프로그램 | in silico.zip | |
| 매뉴얼 | Manual - in silico experiment.pdf | |
| 모식도 |
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| 웹 서비스 | 주소 | |
| 주요 내용 | 특징 | 사용자가 입력한 NGS 데이터에 대해서 가설을 검증할 수 있는 도구이다. 먼저 사용자가 입력한 자연어로 된 가설을 유전자 세트로 바꾸어 주고, 입력한 유전자의 발현 정보를 이용하여 세가지 생물학 네트워크 (TF, PPI, miRNA 네트워크) 를 이용하여 조절 네트워크를 만든 후, 만들어진 네트워크의 복잡도를 계산하여 가설을 검증한다. 복잡도가 높을 수록 유전자 간의 높은 연관성을 의미하여 가설 검증이 가능하도록 하였다. |
| 주요 기능 | 사용자가 웹을 통해 쉽게 이용 가능하도록 만들어 졌으며, 유전자의 발현 정보로부터 가설을 검증하기 위한 유전자 간의 네트워크 분석을 하도록 만들어 졌다. | |
| 사용방법 | ||
| LINUX | ||
| 기타 | ||