Study : 1711044752
연구과제 정보
| 2014M3C9A3063541 | |
| 1711044752 | |
| 멀티 오믹스 분석 알고리즘 및 플랫폼 개발 | |
| 미래부 | |
| 서울대학교 | |
| 김선 | |
| 2016 | |
| 2016-11-01 ~ 2017-08-31 | |
| 김선 | |
| sunkim.bioinfo@snu.ac.kr | |
| 028807280 |
등록 프로그램 / 파이프라인 / 웹 서비스 정보
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1. 분석 프로그램 2. 기타 분석 |
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| 한글명칭 | 클립진 | |
| 영문명칭 | CLIP-GENE | |
| 프로그램 | clip-gene_mini.tar.gz | |
| 매뉴얼 | CLIP-GENE_Manual.xlsx | |
| 모식도 |
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| 웹 서비스 | 주소 | |
| 주요 내용 | 특징 | 사용자의 관심있는 context (실험 디자인, 목표)에 가중치를 두어 gene을 ranking하는 literature search system이 도입된 Gene prioritization 웹 도구 |
| 주요 기능 | RNA-seq의 결과물인 SNV, DEG를 Input으로 사용하여, PPI, Literature search, Gene Regulatroy Network를 고려하여 연구자의 실험조건에서 가장 phenotype에 영향을 주었을 유전자를 선정 | |
| 사용방법 | 사용자가 DEG, SNV profile이 있다면 웹 서비스를 통해 epigenentics.snu.ac.kr/CLIP-GENE 을 방문하여 간단하게 사용할 수 있다 | |
| Windows Vista,LINUX | ||
| JAVA,PHP,기타 | ||