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Study : 1711044752

연구과제 정보

accession,
2014M3C9A3063541
1711044752
멀티 오믹스 분석 알고리즘 및 플랫폼 개발
미래부
서울대학교
김선
2016
2016-11-01 ~ 2017-08-31
김선
sunkim.bioinfo@snu.ac.kr
028807280

등록 프로그램 / 파이프라인 / 웹 서비스 정보

accession,

1. 분석 프로그램   2. 기타 분석

한글명칭 클립진
영문명칭 CLIP-GENE
프로그램 clip-gene_mini.tar.gz
매뉴얼 CLIP-GENE_Manual.xlsx
모식도 프로그램 전체 모식도 없음
웹 서비스 주소
주요 내용 특징 사용자의 관심있는 context (실험 디자인, 목표)에 가중치를 두어 gene을 ranking하는 literature search system이 도입된 Gene prioritization 웹 도구
주요 기능 RNA-seq의 결과물인 SNV, DEG를 Input으로 사용하여, PPI, Literature search, Gene Regulatroy Network를 고려하여 연구자의 실험조건에서 가장 phenotype에 영향을 주었을 유전자를 선정
사용방법 사용자가 DEG, SNV profile이 있다면 웹 서비스를 통해 epigenentics.snu.ac.kr/CLIP-GENE 을 방문하여 간단하게 사용할 수 있다
Windows Vista,LINUX
JAVA,PHP,기타