유전체 정보 연계 시스템 Genome InfraNet

분석 프로그램 검색

Study : 1711044765

연구과제 정보

accession,
2014M3C9A3063544
1711044765
드노보 유전체 어셈블리를 위한 참조 유전체 기반 하이브리드 시스템 개발
미래부
건국대학교
김재범
2016
2016-11-01 ~ 2017-08-31
김재범
Jaebum.Kim@gmail.com
4500456

등록 프로그램 / 파이프라인 / 웹 서비스 정보

accession,

1. 데이터 가시화 프로그램   2. 대용량 유전체 분석

한글명칭 신터니포탈
영문명칭 Synteny Portal
프로그램 Synteny_Portal.zip
매뉴얼 Synteny_Portal_manual.xlsx
모식도 프로그램 전체 모식도 없음
웹 서비스 주소
주요 내용 특징 주어진 둘 이상의 염기서열 데이터 및 신터니 정보를 circos plot 및 linear plot으로 가시화하여 염기서열 간의 관계 및 구조를 보여줌. 사용자가 선택한 염색체 및 스캐폴드들의 관계를 직관적으로 시각화 해주고, 쉬운 조작으로 특정 관계 강조 및 상세정보 확인이 가능함. 신터니 정보 내에 유전자 브라우징 기능을 제공하여 비교유전체 및 종 진화 연구에 유용하게 활용 가능함.
주요 기능 - 다수 종의 보존 염기서열 (신터니) 탐색 - 신터니 정보를 circos plot 및 linear plot으로 시각화 - 신터니 내 유전자 정보 브라우징
사용방법
LINUX
PHP,PERL,기타