유전체 정보 연계 시스템 Genome InfraNet

분석 프로그램 검색

Study : 1711042980

연구과제 정보

accession,
2014M3C9A3064815
1711042980
질병 연관 유전체주석정보에 기반한 driver pathway 예측 시스템 개발
미래부
한양대학교(ERICA캠퍼스)
이영식
2016
2016-10-01 ~ 2017-07-31
조수영
singylu@hanmail.net
01020369471

등록 프로그램 / 파이프라인 / 웹 서비스 정보

accession,

1. 웹 서비스   2. 전사체 분석

한글명칭 ASpedia
영문명칭
프로그램
매뉴얼 pipeline_manual_sample_aspedia.xlsx
모식도 프로그램 전체 모식도 없음
웹 서비스 주소 http://combio.snu.ac.kr/aspedia/
주요 내용 특징 ● RNA-Seq 기반의 differential AS 분석의 경우 표준화 되어 있는 양식이 별도로 존재하지 않으며 대부분의 분석 프로그램이 ASpedia 수준의 annotation 정보를 제공하지 못함. ● ASpeia 프로그램은 기존 differential AS 분석으로부터 도출된 AS event 들의 annotation을 지원하도록 다양한 AS 프로그램들을 위한 플러그인을 개발, 프로그램을 연구자들에게 공개함. 플러그인으로부터 input 파일을 생성하고 이를 ASpedia에 업로드하면 AS event 검색 결과, annotation 정보, genomic browser의 기능을 동시에 사용 가능함.
주요 기능 ● ASpedia를 활용한 데이터베이스 annotation 시스템 및 브라우저
사용방법
LINUX
JAVA,PHP