Study : 1711044752
연구과제 정보
| 2014M3C9A3063541 | |
| 1711044752 | |
| 멀티 오믹스 분석 알고리즘 및 플랫폼 개발 | |
| 미래부 | |
| 서울대학교 | |
| 김선 | |
| 2016 | |
| 2016-11-01 ~ 2017-08-31 | |
| 김선 | |
| sunkim.bioinfo@snu.ac.kr | |
| 028807280 |
등록 프로그램 / 파이프라인 / 웹 서비스 정보
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1. 웹 서비스 2. 전사체 분석 |
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| 한글명칭 | 파인트넷 | |
| 영문명칭 | PINTnet | |
| 프로그램 | ||
| 매뉴얼 | PINTnet 파이프라인 매뉴얼.xlsx | |
| 모식도 |
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| 웹 서비스 | 주소 | http://biohealth.snu.ac.kr/software/PINTnet/ |
| 주요 내용 | 특징 | 본 프로그램은 패스웨이 상호작용 네트워크를 구축해주는 프로그램이다. 질병 등의 특정 조건에 있는 실험군이 대조군에 비해 얼마나 패스웨이의 상호작용이 활성화되었는지에 따라 패스웨이 상호작용 네트워크를 구축해준다. |
| 주요 기능 | - 패스웨이 상호작용 네트워크 구축 - 네트워크에 속한 패스웨이 검색 - 각 패스웨이의 세부 정보 제공 - 패스웨이 이름 - 패스웨이 ID - 패스웨이에 속한 유전자 개수 - 인접한 패스웨이 정보 - 서브네트워크 구성 | |
| 사용방법 | 사용자는 유전자 발현량 데이터를 정해진 형식에 따라 업로드하고 e-mail 주소를 입력한다. 입력된 e-mail 주소로 작업 고유 번호가 전송되며 사용자는 이 작업 고유번호로 본인이 수행한 작업의 결과에 접근할 수 있다. 실행이 완료되면 미리 정해진 기본 cutoff 이상의 상호작용 점수를 갖는 엣지로 만 구성된 패스웨이 상호작용 네트워크가 결과 화면에 나타난다. 사용자는 cutoff를 조절하여 네트워크의 엣지 수를 조절할 수 있다. 탐색 모드에서는 노드를 클릭하거나 검색창에 패스웨이의 정보를 입력함으로 네트워크에 속한 패스웨이를 검색할 수 있다. 이 때, 선택된 패스웨이의 상세 정보(이름, ID, 유전자 개수 등)를 확인할 수 있다. 서브네트워크 모드에서는 관심 있는 패스웨이만 선택하여 서브네트워크를 구성하여 연결도를 볼 수 있다. | |
| LINUX | ||
| PERL | ||