유전체 정보 연계 시스템 Genome InfraNet

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Study : 1711044752

연구과제 정보

accession,
2014M3C9A3063541
1711044752
멀티 오믹스 분석 알고리즘 및 플랫폼 개발
미래부
서울대학교
김선
2016
2016-11-01 ~ 2017-08-31
김선
sunkim.bioinfo@snu.ac.kr
028807280

등록 프로그램 / 파이프라인 / 웹 서비스 정보

accession,

1. 분석 파이프라인   2. 기타 분석

한글명칭 유전자 표시자 발굴을 위한 통합 분석
영문명칭 Combined Analysis for Finding Gene Marker
프로그램 CAFF_gene.py
매뉴얼 pipeline_manual_sample.xlsx
모식도 프로그램 전체 모식도 없음
웹 서비스 주소
주요 내용 특징 GRN를 이용하여 유전자 조절 기능이 있는지 확인하고, PPI를 이용하여 KO 유전자와 인접한지 확인하고, SNV를 이용하여 개체간의 차이가 없는지 확인한다.
주요 기능 다수의 정보(GRN, PPI, SNV)를 이용하여 중요 유전자 표시자(gene marker)의 후보를 선정
사용방법
LINUX
기타
Python2.7 이상