GenomeInfraNet 시스템(GINs)은 2014년부터 범부처 차원에서 시작된 ‘포스트게놈 다부처 유전체사업’에서 생산된 모든 유전체 정보를 통합 관리하는 시스템입니다. 포스트게놈다부처유전체사업: 유전체 연구를 통한 국민건강증진과 산업화 연계시스템 구현을 목표로 2014-2021년(8년) 동안 1)맞춤의료 및 예방의료 구현을 위한 예방, 진단, 치료 기술개발, 2)동식물 해양생물 등 유전정보를 활용한 고부가가치 생명자원 개발, 3)유전체 원천기술 및 고도의 정보분석 기술확보, 인력양성, 국제협력을 미션으로 수행하는 사업
  • • 정부 7개 부처청(과기정통부, 복지부, 산업부, 해수부, 농식품부/농진청/산림청)의 다부처유전체 과제에서 생산되는 유전체 정보는 일차적으로 연구자들이 해당 부처의 정보센터에 등록을 하고, 각 부처 정보센터는 등록된 유전체 정보를 국가생명연구자원정보센터(KOBIC)으로 등록합니다.
  • • KOBIC은 각 부처 유전체정보센터에서 등록된 유전체 정보를 위한 통합시스템인 GINs을 구축하였으며, GINs를 통해서 등록된 유전체를 유전체 연구자 및 산업체에서 활용할 수 있는 서비스를 제공하고 있습니다.
  • • KOBIC은 5개 부처 유전체정보센터와 긴밀히 협력하고 있으며, 데이터의 등록을 위해서 표준작업절차서(Standard Operation Protocol, SOP)를 지정하였으며, 이를 SOP를 기준으로 각 부처정보센터로부터 유전체 정보를 이관 받고 있습니다.
  • • KOBIC은 유전체 정보의 활용을 위하여 Bio-Express라는 클라우드 기반의 유전체 정보 분석 서비스를 제공하고 있습니다. Bio-Express는 각 유전체 타입별 분석 방법에 따라서 다양한 분석 파이프라인을 제공하고 있으며, 대용량 데이터의 업로드를 위해서 초고속 파일전송 프로그램인 GBox를 개발하여 제공하고 있습니다. 자세한 내용은 클라우드 서비스 메뉴를 참고해 주세요.

소개

국가생명연구자원정보센터(KOBIC)에서 운영하고 있는 Genome-InfraNet 시스템(GINs)은 2014년부터 범부처 차원에서 시작된 ‘포스트게놈 다부처 유전체사업’에서 생산된 1차 또는 2차 유전체 정보를 수집, 통합관리, 활용을 위한 시스템입니다.

포스트게놈 다부처 유전체사업

“포스트게놈 다부처 유전체사업”

유전체 연구를 통한 국민건강증진과 산업화 연계시스템 구현을 목표로 7개부처청이 공동으로2014-2021년(8년) 수행하는 사업으로 아래의 목표를 가지고 있습니다.

[관련 7개 부처청: 과기정통부, 복지부, 산업부, 해수부, 농식품부/농진청/산림청]

  • 1) 맞춤의료 및 예방의료 구현을 위한 예방, 진단, 치료 기술개발
  • 2) 동식물 해양생물 등 유전정보를 활용한 고부가가치 생명자원 개발
  • 3) 유전체 원천기술 및 고도의 정보분석 기술확보, 인력양성, 국제협력을 미션으로 수행하는 사업 포스트게놈 다부처 유전체사업에 대한 전반적인 내용은 ‘포스트게놈 다부처 유전체사업 총괄지원단’을 참고하시면 됩니다.

유전체 정보 등록 연계 및 관리 체계

  • 다부처 유전체사업을 수행하는 과제책임자는 생산한 유전체 정보를 해당 부처의 유전체정보센터(표)에 등록하고, 각 부처 유전체정보센터에 등록된 유전체 정보(1차 정보 및 2차 정보)는 수요자 중심으로 최대한 활용될 수 있도록 KOBIC으로 공유 연계되고 있습니다. ※ 유전체 정보의 “1차 정보”는 유전자 염기서열 분석기기를 활용하여 생산된 원 유전체정보(예, FASTQ 포맷) 또는 참조서열에 정렬한 유전체 정보(예, SAM 또는BAM 포맷)를 말하고, “2차 정보”는 연구 목적 달성을 위해 계산 및 분석을 하여 기능 분석이 가능한 형태로 가공된 유전체 정보(예, VCF 포맷)를 의미합니다.
  • KOBIC은 5개 부처 유전체정보센터와 긴밀히 협력하고 있으며, 유전체 정보의 등록 및 교환을 위해서 유전체 정보의 표준작업절차서(Standard Operation Protocol, SOP)를 지정하였으며, 이를 SOP를 기준으로 각 부처 유전체정보센터로부터 유전체 정보를 이관 받고 있습니다(’19.4월 SOP 2차 개정)
  • KOBIC은 유전체 연구자들의 원활한 유전체 정보의 분석 및 활용을 촉진하고자 Bio-Express라는 클라우드 기반의 유전체 정보 분석 시스템을 자체적으로 개발하여 서비스를 제공하고 있습니다. Bio-Express는 각 유전체 타입별 분석 방법에 따라서 다양한 분석 파이프라인을 제공하고 있으며, 대용량 데이터의 업로드를 위해서 초고속 파일전송 프로그램인 GBox를 개발하여 제공하고 있습니다.